LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA
  • Bem vindo ao Laboratório de Bioinformática – UFSC

    Publicado em 05/03/2012 às 19:09

    logo_bioinformaticaO Laboratório de Bioinformática do Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia (MIP) da Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC) foi fundado em 2002 com o suporte financeiro do Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq), através de projetos de pesquisa do Grupo Multidisciplinar de Bioinformática.

    Localizado no MIP/CCB/UFSC, o laboratório desenvolve pesquisas em colaboração com o Laboratório de Bioinformática do Laboratório Nacional de Computação Científica (LNCC/MCT), com Centers for Disease Control and Prevention (CDC, EUA), Laboratório de Biologia Computacional e de Sistemas do Instituto Oswaldo Cruz (Fiocruz), entre outros.

    Visando o desenvolvimento e/ou aprimoramento de ferramentas de análise computacional de sequências nucleotídicas e proteicas, assim como sua disponibilização para a comunidade científica, o laboratório está associado ao Laboratório de Protozoologia da UFSC, focando suas atividades especialmente em protozoários patogênicos.

    Jan, 2018


  • Processo pré-seletivo conjunto: Laboratórios de Protozoologia, de Bioinformática e Neoprospecta Microbiome Technologies

    Publicado em 07/02/2018 às 11:27

                 

     

    Os Laboratórios de Protozoologia e de Bioinformática da Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC) em conjunto com a Neoprospecta Microbiome Technologies estão realizando processo pré-seletivo para alunos de pós-graduação em nível de Mestrado e de Doutorado visando o processo seletivo do Programa de Pós-graduação em Biotecnologia e Biociências da UFSC em Florianópolis.

    O editais estão abertos até 20/02/2018 e requerem carta de aceitação dos prováveis orientadores.

    Os alunos aprovados no processo de pré-seleção e seleção, farão pós-graduação stricto-sensu, devendo cumprir todos os requisitos estabelecidos pelo regimento interno e edital do Programa. Adicionalmente, o aluno irá, se for do seu interesse, vivenciar um ambiente de empreendedorismo biotecnológico no âmbito da interação academia-empresa.

    Áreas de Pesquisa:

    Biologia molecular de microrganismos (Experimental):

    • Estudos funcionais para identificação de novos alvos para diagnóstico e controle de microrganismos;
    • Desenvolvimento e aplicação de tecnologias moleculares para identificação, diagnóstico e tratamento de microrganismos;

    Dentro dessa área, dependo do projeto, os alunos terão contato com cultivo de microrganismos, extração de DNA/RNA e proteínas, sequenciamento de nova geração, PCR e PCR em tempo real, clonagem, técnicas de hibridização e transfecção de ácidos nucleicos, citometria de fluxo, técnicas de microscopia, dentre outras.

    Filogenômica de micro-organismos (Bioinformática):

    • Desenvolvimento e aplicação de algoritmos, e pipelines para filogenômica e genômica comparativa de microrganismos;
    • Desenvolvimento e aplicação de ferramentas para identificação de mecanismos de virulência, resistência à antimicrobianos e alvos para diagnóstico, tratamento e produção de vacinas.

    Dentro dessa área, além das disciplinas do curso, os alunos terão treinamento e desenvolverão habilidades em análise de genomas, montagem e anotação de genes, uso de ferramentas para análise filogenética, e também treinamento para desenvolvimento com Python, Django e integração de sistemas por REST API e em metodologias de desenvolvimento ágeis, usando Scrum e Git Hub Flow, dentre outras.

    Se você tem interesse em fazer uma imersão científica e tecnológica durante sua pós-gradução em um ambiente desafiador, estimulante e multi-disciplinar, que conta com um time altamente qualificado e uma infraestrutura de ponta, esse é o seu lugar!

    Contatos:

    Laboratório de Protozoologia: 

    Dra. Patrícia Stoco (patricia.stoco@ufsc.br)

    Laboratório de Bioinformática:

    Dr. Glauber Wagner (glauber.wagner@ufsc.br)

    Neoprospecta Microbiome Technologies:

    Dr. Luiz Felipe Valter de Oliveira (felipe@neoprospecta.com)